Чи безпечно це?

Так. Усі зміни відкочуються однією кнопкою. Точка відновлення Windows створюється автоматично. Бекап реєстру та служб — у %LocalAppData%\FlowSync\Backups\. Програма підписана HMAC, перевіряється під час кожного запуску. Відкритий репозиторій зі changelog — у Telegram-каналі.